泰石奉命 打击反贼
衍因破解茶园有毒的玄机后，透露曾目睹黑影闯茶园，成功为万昌洗脱嫌疑。孝庄感激福全舍命相救，加上她婉拒一切赏赐，使孝庄深信她是存心悔改。孝庄要求康熙将长期留守关外的五孙儿常宁调返京师共度佳节。
福全下令布齐五日内缉兇，多宝提醒疑兇手背会有被她打伤的痕迹，布齐认定「百喜堂」上下有可疑，派人监视紫凝等人。
收纳哈善 迅速破案
紫凝以调虎离山计骗倒尔豪等人，成功避过耳目，替翠玉找到金创药。多宝担心万昌受惊而向她致歉，表示相信她是无辜，承诺定必查出真相，还万昌一个公道。
哈善安排众人份组到福全中箭的现场调查，多宝与恩泽发现端倪，并成功推断出可疑人士及案发经过，遂设局测试疑兇，谁知令哈善想到事件或与福全有关，阻止多宝向外公布调查结果。
福全直认与事件有关，更推心置腹向哈善权衡利害，乘机将她收为己用。哈善迅速破案，找到刺杀福全及毒害孝庄的主谋，泰石等人大感意外，多宝更觉得当中疑点重重。
孝庄准许 福全议政
福全向孝庄交代破案的细节，她大赞孙儿办事干净俐落，决定让她担任议政大臣，留在康熙身边商议军机大事。孝庄认定万昌似曾相识，决定派布齐往调查其底蕴。哈善向福全汇报布齐暗中调查万昌一事，使她感到奇怪，着哈善要早一步查出缘由，并且监视一切与孝庄有密切来往的官员。
多宝喜闻福全晋升议政大臣，为好友一展所长感到兴奋，福全承诺会让多宝今后扶摇直上。福全向多宝透露布齐常恃着背后有靠山，对其阳奉阴违，暗中调查万昌一事，并赞赏哈善的办事能力，着多宝别多疑。
隐瞒真相 万昌自杀
万昌担心被识破身份，有意离开寺院，被衍因留住。福全与明珠在南书房陪康熙议政，福全事事附和，又欣然答应出席宴会，与明珠的门生见面。
多宝查得万昌曾往拜祭道廷，使福全忆起早年与道廷的渊源。多宝忆起衍因曾透露自己是道廷的徒弟，使她觉得衍因或许知道个中秘密，谁知衍因竟取出玉佩着她向贯一问及内情。
布齐发现万昌虚报户籍，派人暗中将她缉捕，以免被哈善发现通报福全。多宝早一步找到万昌，欲向她了解更多内情时，万昌竟乘她不为意时自杀。
紫禁惊雷分集剧情介绍第13集 - 惠妃失势 被困冷宫万昌多宝 父子相认
多宝被血流如注的万昌吓坏，幸得一直跟踪二人的衍因赶至替万昌处理伤口，眼看多宝不明万昌何以自寻短见，衍因决定将二人的关係相告。多宝惊悉孝庄当年为保秘密，竟狠心令祈家灭门后不禁激动，并恍然衍因何以一直阻止他担任御前侍卫。
衍因希望多宝可以带同万昌到关外的佛寺暂避，但多宝则以欲继续扶助福全为由留下。多宝为免贯一等受牵连，返家虚称自己未有找到亲人。
曼筠涉害 惠妃滑胎
惠妃突然宣告滑胎，孝庄与康熙赶至了解情况，惠妃指服用安胎药后突感不适，太医检查药渣后，证实当中多了一款十分寒凉的药材，又暗示曾处方此药予曼筠，使她百词莫辩。孝庄坚信曼筠本性纯良，绝非毒害惠妃胎儿的真兇，康熙表示会彻查内情。
桂伦就曼筠再次被诬陷一事试探丈夫，福全表示以康熙的英明，定必可以查过水落石出，加上后宫的事实在不宜插手，著桂伦别担心。
福全再次勾起与曼筠甜蜜的回忆，决定向康熙自荐调查此案。康熙自觉曼筠善良，但又难以相信惠妃会毒害胎儿，故欣然答应由福全查出真相。福全往找曼筠了解她身体不适的经过，过程巧合得令福全难以置信，遂使计掳走太医审问……。
桂伦看穿 福全私心
孝庄与福全目睹太医夜访惠妃寝宫，并搜出大批情诗，太医道出惠妃滑胎的真相及如何诬陷曼筠的经过，惠妃哭求眾人原谅，但澄清二人绝无不轨，并激动辱骂孝庄等人，结果被康熙打入冷宫静思己过。
曼筠感谢福全代她取回公道，未料福全仍对她心存寄望，不但直斥康熙一再宠信奸妃，更提起当年相恋的甜蜜情景，终迫使曼筠对他作出最后警告。桂伦无意中得悉福全自荐还曼筠清白一事后大怒，斥责丈夫曾表示拒牵涉后宫事端，福全冷静表示自己职责所在，却被桂伦看穿他另有私心，福全终於按捺不住向桂伦大发雷霆。
冷宫陈妃 逃到宫外
惠妃欲在冷宫自縊，混乱中另一长住冷宫的陈妃竟随剧团离宫。多宝到虚云寺照顾万昌，被衍因问及何以辞官避世感到苦恼。紫凝再次接近多宝打探消息，二人却遇上陈妃在街上大吵大闹。福全发现孝庄命令布齐调查陈妃的下落，却拒绝提供任何线索，遂著哈善必须早一步找到陈妃。紫凝与多宝再遇陈妃，惊见她正準备将一名村民的女儿投进水井内。
